> 以前の設定例は見ていて，手元の画面解像度に合わせて値を入れているのですが，
> それでも下端がはみ出してしまうので，先の発言でした。
そうだったんですか、それを聞いて私が勘違いしていることに気が付きました。
windowresolution = 1336x768
この指定では行数制限を入れていないとはみ出てしまうようです。
行数制限とは、[dosbox] セクションで
vtext1 = svga,40
# vt1 svga,40 解像度 800× 600 文字 100×37〜40 (40行なら画面をはみ出さない)
vtext2 = xga,44
# vt2 xga 解像度 1024× 768 文字 128×48〜80 (44行なら画面をはみ出さない)
vtext3 = sxga,44
# vt3 sxga 解像度 1280×1024 文字 160×64〜75 (44行なら画面をはみ出さない)
#vtext4 = vga
# vt4 vga 解像度 640× 480 文字 80×30〜51 (44行なら画面をはみ出さない)
vtext4 = sxga24,29
# sxga24 解像度 1280×1024 文字 106×42〜51 (29) 24ドットフォント
# xga24 解像度 1024× 768 文字 85×32〜60 (29) 24ドットフォント
このように各自のディスプレイで、はみ出ない行数を指定することで、はみ出なくなります。
ややこしいので私は上のようにコメントを入れています。
> 想像するところ，FHD のような高解像度だと文字等の拡大率を別に設定するわけですが，
> （150%推奨のところを125%にしているけど）こういうのが影響しているかもしれません。
これが影響するかはわかりませんが、上記の設定で試してみてください。
備忘録にも追記しておきます。