ドラ焼きシロップさん、こんにちは。

> 現状では、「*」が「`」になってしまったり、「;」やF1〜F10などのキーがどこにも割り当てられてなかったりして、何かと不便なので、設定ファイルで変更できないかな、と思っているのですが……

Vzをお使いなのでしょうか。
私もあまり使い込んでないので、よくわかってないですが、現状NP2で使えるキーは

Fn+ - = \
Fn+ E = +
Fn+ K = *
Fn+ L = `
Fn+ O = _
Fn+ P = @
Fn+ R = |
Fn+ W = ;
Fn+ Enter = F6
 
\ + , = :　　　　　;　 \ はシフトを表す
\ + . = ^
\ + / = ?

受話ボタンの上のボタン = F1
終話ボタンの上のボタン = F2
OKボタン = F6

このくらいでしょうか。あと、NP2のソース中のUPDATE.TXTから引用すると

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　・キー設定について
　　bios.romとかと同じフォルダに key.txtというファイル名のテキストファイルを
　　作成して、キー設定を記入して下さい。

　　書式)
　　　[keyname] = [key1] (key2) (key3)
　　　[keyname] [TAB] [key1] (key2) (key3)
　　　userkey[1-2] = [key1] (key2) (key3) ... (key15)
　　　　フルキー 0〜9 A〜Z - ^ \ @ [ ] ; : , . / _
　　　　         STOP COPY ESC TAB BS RET SPC XFER NFER
                 INS DEL RLUP RLDN HMCL HELP
　　　　ファンク F1〜F10 VF1〜VF5
　　　　テンキー [0]〜[9] [-] [/] [*] [+] [=] [,] [.]
　　　　シフト   SHIFT CAPS KANA GRPH CTRL

　　　通常キーは3個、userkeyは15個の同時押し設定が可能です。
　　　[=] キーは = で区切られてしまうので TABで区切るか [EQU]として下さい。

　　　例:
　　　　W = UP                 (ダイアモンドキーをカーソルにしてみたり…)
　　　　S = LEFT
　　　　D = RIGHT
　　　　X = DOWN
　　　　[7] = [4] [8]          (テンキー斜め同時押しにしてみたり…)
　　　　[9] = [6] [8]
　　　　[1] = [4] [2]
　　　　[3] = [6] [2]
　　　　userkey1 = CTRL XFER   (CTRL+XFER FEP切り替え)
　　　　userkey2 = D O A Z     (D+O+A+Z 同時押し)

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これを見ても使い方がよくわからないですが、試しに

 * = +
 + = 
 : = ;
 ^ = :
 ; = ^

という内容でkey.txtを作り、NP2のあるフォルダに入れて起動したところ、
\, で ;　\. で :　が出力され、キートップの刻印通りとなりました。(^_^)
既存のキーの入れ替えには使えそうですが、シフトキーの入力の仕方がわからない
ですね。

根本的にはNP2本体で対応するべきなんですが、すぐには無理なので、しばらく
おまちください。